حجت الاسلام آقاتهرانی در پی برگزاری پرشور انتخابات ریاست جمهوری سال ۱۴۰۰ و حضور گسترده مردم و انتخاب حجت الاسلام آقای رئیسی به عنوان رئیس جمهور منتخب مردم پیامی به شرح زیر صادر کردند:
بسم الله الرحمن الرحیم
در ایام کرامت؛ ولادت بی بی فاطمه معصومه علیها سلام و امامنا الرئوف علی بن موسی الرضا علیه صلوات الله مردم ما در انتخابات ریاست جمهوری چه خوش درخشیدند و به امامنا الخامنهای زید عزه چه خوب لبیک گفتند، تا آن که به لطف الهی آن خادم حریم الرضا به ریاست جمهوری راه یافت. خداوند را بر همه نعمت هایش شکر و سپاس.
گذشته از تبریک به برادرم آقای رئیسی، امیدوارم که آن سید عزیز چون گذشته، زیر سایه آن اولیاء الهی موفق بوده و بتواند طعم شیرین خدمت خالصانه را به این شایسته مردم بچشاند. کمال این نظام اسلامی ظهور حضرت بقیه الله ارواحنا فداه است که انشاءالله در دوران این دولت تحقق یابد. آمین.
مرتضی آقاتهرانی